El selenio y la anotación del genoma Sergi Castellano

Gran parte de nuestro trabajo se centra en la identificación y caracterización de los elementos funcionales en genomas eucariotas, principalmente con el selenio que dependen de los genes como nuestro sistema de estudio. Por un lado, podemos desarrollar y aplicar herramientas computacionales para identificar selenoproteínas y otras características genómicas. Por otro lado, se utiliza la genética de poblaciones y evolución molecular enfoques para estudiar su evolución. Dado que la nutrición es una fuerza prominente selectiva en los seres humanos y otros primates, estamos especialmente interesados en saber si las diferencias en la dieta de selenio han dado forma a la utilización y la regulación de selenoproteins en estas especies. También estamos interesados en aspectos más teóricos de la evolución de la secuencia.

Los proyectos en curso incluyen:

  • El entender la base genética de las adaptaciones en la regulación de genes selenoprotein a los niveles de selenio en la dieta de los primates.
  • Evaluación de la intercambiabilidad entre la cisteína y la selenocisteína, el ácido amino 21a en el código genético, en función de las proteínas.
  • Las bases de datos: SelenoDB .
  • Desarrollo de software: simulación de la divergencia en la secuencia en explícitas presiones selectivas.
  • Surtido de problemas de análisis genómico.

 

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